PRGDB00067000 (At.66942)
At.66942 | |
---|---|
Gene Type | Putative_R-Genes,_predicted_from_NCBI_UniGene |
GenBank | 145337319 (NM_105594) |
Gene Class | RLP |
Domain Type | LRR, Ser-Thr Kinase |
Gene Species | Arabidopsis thaliana |
DNA Sequence
AATGTCATTTTCTTTTTGAGTAAAGAAACTTTCTTCTTTTGCAACTTGAAAATTTTCGATTTCGAGAGCGAAGGAagagagagagagagggagagatcaaaaaaatttgtgaaaaaagagatttattttagggttttgttgattttctttgttcattttgccgtcgtctctttctctttcTCTTGTGAAGAAAAAGAAGAAAAATGAAACTTCTGGGTTTGGTCTTCTTGCTGTTTAATCTGTTTATGTTTTCGTTTTCTCGGAAACTTTTAACCGAGAGTGGTGGTGGTCTCCACGACGAAGCTGCTCTGTTGAAGTTGAAGAGTAGTTTCTTGGATCCAAATGGAGTTCTGTCTAGCTGGGTTTCCGACAGCTCATCAAACCATTGTTCTTGGTACGGTGTCTCTTGCAACTCTGATTCGAGAGTCGTTTCTTTAATTCTCAGAGGCTGTGATGAGCTTGAAGGTAGTGGTGTTCTTCATCTCCCAGATTTGTCTTCTTGTTCTTCAAGTAAAAGAAGACTTGGTGGTGTAATCTCTCCTGTTGTTGGAGATTTGTCTGAAATTAGGGTTTTATCTCTGTCTTTTAATGATCTTAGAGGTGAGATTCCAAAGGAGATTTGGGGGTTGGAGAAATTAGAGATTCTTGATCTTAAAGGTAACAACTTTATCGGTGGAATTAGGGTTGTTGATAATGTTGTTCTTAGGAAACTTATGAGTTTTGAGGATGAAGATGAAATTGGTCCAAGCTCAGCTGATGATGATTCTCCTGGTAAATCTGGATTGTATCCGATTGAGATAGCTTCTATTGTGTCAGCTTCAGTGATTGTCTTTGTGCTTCTTGTTCTTGTGATCTTGTTCATCTACACGAGGAAATGGAAACGAAACTCTCAGGTTCAGGTAGATGAGATCAAGGAGATTAAAGTGTTTGTTGACATTGGTATTCCTCTGACGTATGAGATCATTGTTAGAGCTACTGGTTACTTTAGTAACTCTAACTGTATCGGTCACGGCGGTTTCGGTTCGACTTATAAAGCAGAGGTGTCTCCAACGAATGTGTTTGCTGTTAAAAGACTCTCTGTTGGGAGGTTTCAAGGTGATCAACAGTTTCATGCTGAGATCTCTGCTCTTGAGATGGTTAGGCATCCGAATCTTGTTATGTTAATCGGTTACCATGCGAGCGAAACCGAGATGTTTCTTATTTACAACTACTTATCTGGAGGAAACCTTCAAGATTTCATTAAAGAGAGATCGAAAGCTGCTATTGAGTGGAAGGTACTTCACAAGATTGCTCTTGATGTAGCGCGTGCTCTCTCCTATCTTCACGAACAGTGTTCTCCTAAAGTCTTGCATAGAGATATCAAACCGAGTAACATACTCTTGGACAACAACTACAACGCTTATCTATCTGATTTCGGACTCTCGAAACTCTTGGGAACTTCGCAGTCTCATGTCACAACTGGTGTGGCTGGAACATTCGGATATGTAGCTCCAGAGTACGCAATGACATGCCGAGTCTCGGAGAAAGCAGATGTTTACAGCTATGGGATAGTCCTCTTGGAGCTGATATCGGACAAACGAGCTCTGGATCCTTCTTTCTCATCGCATGAGAACGGGTTCAACATTGTCTCGTGGGCTCATATGATGTTGAGTCAAGGCAAAGCGAAAGAAGTCTTCACCACAGGACTATGGGAGACTGGTCCTCCAGACGATTTGGTCGAGGTTCTGCATTTGGCACTCAAATGCACCGTCGATAGCCTCTCGATAAGGCCGACAATGAAACAAGCTGTAAGACTGCTGAAACGAATCCAGCCTTCTAGATTGTGATACAAAGCTAGAAGAAAGGTGTTTTTAGAGGATTTGTACAGCAGCAAACAAGTGCCTAGCCATTAGAATCTTTCTCAAGTCTGTTTTTTATATTTTCAGTGCTAGGGAGGTTTTTCATATGCATCATCAAAATGTTATTCTCAGTCTACTCTCTTGAAAACTGATATAAATGATGTTTCTTTCTCCTT
Protein sequences
Name | Description | Sequence |
---|---|---|
At.66942 | translated coding region predicted by ESTScan from UniGene At.66942 | MKLLGLVFLLFNLFMFSFSRKLLTESGGGLHDEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCNSDSRVVSLILRGCDELEGSGVLHLPDLSSCSSSKRRLGGVISPVVGDLSEIRVLSLSFNDLRGEIPKEIWGLEKLEILDLKGNNFIGGIRVVDNVVLRKLMSFEDEDEIGPSSADDDSPGKSGLYPIEIASIVSASVIVFVLLVLVILFIYTRKWKRNSQVQVDEIKEIKVFVDIGIPLTYEIIVRATGYFSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVRLLKRIQPSRL |
Domains
Domain | Start-End | Description | Sequence
|
---|---|---|---|
HMMPanther: PTHR24420 | 6-537 | PTHR24420,FAMILY NOT NAMED | LVFLLFNLFMFSFSRKLLTESGGGLHDEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCNSDSRVVSLILRGCDELEGSGVLHLPDLSSCSSSKRRLGGVISPVVGDLSEIRVLSLSFNDLRGEIPKEIWGLEKLEILDLKGNNFIGGIRVVDNVVLRKLMSFEDEDEIGPSSADDDSPGKSGLYPIEIASIVSASVIVFVLLVLVILFIYTRKWKRNSQVQVDEIKEIKVFVDIGIPLTYEIIVRATGYFSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVRLLKRIQP |
HMMPanther: PTHR24420:SF820 | 6-537 | PTHR24420:SF820 | LVFLLFNLFMFSFSRKLLTESGGGLHDEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCNSDSRVVSLILRGCDELEGSGVLHLPDLSSCSSSKRRLGGVISPVVGDLSEIRVLSLSFNDLRGEIPKEIWGLEKLEILDLKGNNFIGGIRVVDNVVLRKLMSFEDEDEIGPSSADDDSPGKSGLYPIEIASIVSASVIVFVLLVLVILFIYTRKWKRNSQVQVDEIKEIKVFVDIGIPLTYEIIVRATGYFSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVRLLKRIQP |
superfamily: SSF52058 | 26-159 | SSF52058,LRR | SGGGLHDEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCNSDSRVVSLILRGCDELEGSGVLHLPDLSSCSSSKRRLGGVISPVVGDLSEIRVLSLSFNDLRGEIPKEIWGLEKLEILDLKGNNFIGGI |
HMMPfam: PF08263 IPR013210
|
31-70 | LRRNT_2 Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain,
|
HDEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCN |
Gene3D: G3DSA:3.80.10.10 | 32-158 | G3DSA:3.80.10.10 | DEAALLKLKSSFLDPNGVLSSWVSDSSSNHCSWYGVSCNSDSRVVSLILRGCDELEGSGVLHLPDLSSCSSSKRRLGGVISPVVGDLSEIRVLSLSFNDLRGEIPKEIWGLEKLEILDLKGNNFIGG |
superfamily: SSF56112 IPR011009
|
247-530 | Kinase_like Protein kinase-like domain
|
IPLTYEIIVRATGYFSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVR |
Gene3D: G3DSA:3.30.200.20 | 250-328 | G3DSA:3.30.200.20 | TYEIIVRATGYFSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASET |
ProfileScan: PS50011 IPR000719
|
261-535 | PROTEIN_KINASE_DOM Protein kinase, catalytic domain
|
FSNSNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVRLLKRI |
HMMPfam: PF00069 IPR017442
|
264-528 | Pkinase,Ser-thr Serine/threonine-protein kinase-like domain
|
SNCIGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVKRLSVGRFQGDQQFHAEISALEMVRHPNLVMLIGYHASETEMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQA |
PatternScan: PS00107 IPR017441
|
267-289 | PROTEIN_KINASE_ATP Protein kinase, ATP binding site
|
IGHGGFGSTYKAEVSPTNVFAVK |
Gene3D: G3DSA:1.10.510.10 | 329-530 | G3DSA:1.10.510.10 | EMFLIYNYLSGGNLQDFIKERSKAAIEWKVLHKIALDVARALSYLHEQCSPKVLHRDIKPSNILLDNNYNAYLSDFGLSKLLGTSQSHVTTGVAGTFGYVAPEYAMTCRVSEKADVYSYGIVLLELISDKRALDPSFSSHENGFNIVSWAHMMLSQGKAKEVFTTGLWETGPPDDLVEVLHLALKCTVDSLSIRPTMKQAVR |
PatternScan: PS00108 IPR008271
|
381-393 | PROTEIN_KINASE_ST Serine/threonine-protein kinase, active site
|
VLHRDIKPSNILL |
List of Contributions
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